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细菌耐药性已成为全球公共卫生威胁,其中耐碳青霉烯类肠杆菌目(CRE)细菌的感染是全球抗感染领域最引人注目的问题之一,原因是临床仅以碳青霉烯类抗菌药物已无法有效治疗此类细菌的感染[1],尤其是新德里金属β-内酰胺酶(NDM)的出现,给防控耐药菌株的传播敲响了警钟,到目前为止,临床可用于治疗产NDM型碳青霉烯酶菌株的药物仍寥寥无几[2-3]。2021年,我国肺炎克雷伯菌(CR-Kpn)对亚胺培南和美罗培南的耐药率分别为20.8%和21.9%,几乎是2005年的7倍(3.0% 和2.9%)。大肠埃希菌(CR-Eco)对亚胺培南和美罗培南的耐药率分别为1.8%和2.0%[4]。此外,研究表明,新冠肺炎可能会加速CRE通过病毒促进细菌附着和呼吸道定植,从而导致CRE在世界各地的传播率有所上升[5-6]。肠杆菌目不同属细菌的耐药性可能由多种机制单独或协同介导,不同菌株主要的耐药机制也不尽相同,对于特定菌株来讲,各个机制之间的协同作用也会大大提高其对碳青霉烯类抗生素的耐受性[7-8]。因此,为应对CRE带来的重大挑战,实验室需做好抗微生物药物敏感性试验,开展针对碳青霉烯类耐药革兰阴性杆菌的酶型检测,为临床的抗感染治疗提供尽其所能的协助。本研究旨在通过评价上海交通大学医学院附属仁济医院浦南分院(本院)CRE对常见临床抗菌药物体外敏感性药敏试验的结果,了解CRE最常见的基因型,以及比较碳青霉烯酶耐药表型和基因型两种不同检测方法,以期为CRE的临床治疗和医院感染控制提供流行病学依据。
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共分离到CR-Kpn及CR-Eco非重复分离株共400株,其中CR-Kpn 195株(48.75%),CR-Eco 205株(51.25%)。51株CRE中CR-Kpn 41株(80.39%)、CR-Eco 10株(19.61%)。CRE菌株大多来自呼吸道,血液和中段尿标本。其中,CR-Kpn来源的前3位标本分别为:痰标本、血标本、中段尿标本,CR-Eco来源的前3位标本分别为:中段尿标本、血标本、导管,具体见表1。此外,41株CR-Kpn主要分布在ICU 21株(51%)和老年科5株(12%);10株CR-Eco主要分布在普外科6株(60%)。
标本类型 CR-Kpn(n=41) CR-Eco(n=10) 株数 构成比(%) 株数 构成比(%) 痰 17 41.46 0 0.00 血液 11 26.83 3 30.00 中段尿 8 19.51 6 60.00 肺泡灌洗液 2 4.88 0 0.00 导管 0 0.00 1 10.00 脓 1 2.44 0 0.00 胆汁 1 2.44 0 0.00 胸水 1 2.44 0 0.00 -
CR-Kpn对美罗培南耐药率为21.03%、对替加环素、多黏菌素B、阿米卡星耐药率为0.00%、4.10%、11.79%,对头孢吡肟、头孢他啶耐药率分别为48.21%、45.64%,对氨曲南、环丙沙星耐药率分别是50.26%、53.85%。CR-Eco对美罗培南耐药率为4.88%,对替加环素、多黏菌素B、阿米卡星耐药率分别为0.00%、0.49%、0.98%,对头孢吡肟、头孢他啶耐药率分别为30.24%、39.51%,对氨曲南、环丙沙星耐药率分别是41.95%、64.88%,见表2。
抗菌药物 肺炎克雷伯菌菌(n=195) 大肠埃希菌(n=205) 耐药 敏感 耐药 敏感 美罗培南 21.03 78.97 4.88 95.12 头孢吡肟 48.21 43.59 39.51 48.78 头孢他啶 45.64 48.72 30.24 62.44 环丙沙星 53.85 41.54 64.88 22.44 替加环素 0.00 97.44 0.00 100.00 多黏菌素B 4.10 95.90 0.49 99.51 阿米卡星 11.79 88.21 0.98 99.02 氨曲南 50.26 47.69 41.95 48.78 注:替加环素折点参考FDA,多黏菌素折点参考杨启文等[11]专家共识,其余均参考CLSI。 -
对 CRE的体外抗菌活性最高的前2位抗菌药物分别为替加环素(0.00%)、多黏菌素B(7.84%)。此外,对CR-Eco体外抗菌活性较高的还包括阿米卡星(90%)和氨曲南(80%),见表3。
抗菌药物 肺炎克雷伯菌菌(n=41) 大肠埃希菌(n=10) 耐药 敏感 耐药 敏感 美罗培南 100.00 0.00 100.00 0.00 头孢吡肟 100.00 0.00 90.00 0.00 头孢他啶 100.00 0.00 100.00 0.00 环丙沙星 100.00 0.00 100.00 0.00 替加环素 2.56 97.44 0.00 100.00 多黏菌素B 10.26 89.74 0.00 100.00 阿米卡星 51.28 48.72 10.00 90.00 氨曲南 100.00 0.00 10.00 80.00 注:替加环素折点参考FDA,多黏菌素折点参考杨启文等[11]专家共识,其余均参考CLSI。 -
51株CRE中检测到碳青霉烯酶49株(96.08%)。耐药表型检测中产NDM型碳青霉烯酶共13株(25.49%)、产KPC型碳青霉烯酶共34株(66.67%)、产OXA酶共2株(3.92%),见表4。耐药基因检测中以产blaKPC为主共34株(66.67%)、以产blaNDM共13株(25.49%)、以产blaOXA-48为主共2株(3.92%),见表5,图1、图2和图3。
耐药表型 CR-Kpn(n=41) CR-Eco(n=10) KPC酶 32(78.05) 2(20.00) NDM酶 5(12.20) 8(80.00) OXA酶 2(4.88) 0 阴性结果a 2(4.88) 0 注:a表示未检测到任何目标碳青霉烯酶。 耐药基因 CR-Kpn(n=41) CR-Eco(n=10) blaKPC 32(78.05) 2(20.00) blaNDM 5(12.20) 8(80.00) blaOXA-48 2(4.88) 0 阴性结果a 2(4.88) 0 注:a表示未检测到任何目标碳青霉烯酶。
Analysis of resistance situation and resistance genes of clinical isolates of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli
doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202309059
- Received Date: 2023-09-26
- Rev Recd Date: 2024-06-08
- Available Online: 2024-10-24
- Publish Date: 2024-10-25
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Key words:
- carbapenem-resistant enterobacteriaceae /
- phenotype of carbapenemase /
- carbapenemase resistance gene /
- resistance
Abstract:
Citation: | HUANG Yun, ZHANG Zhengyin, JIN Ying, ZHENG YiJing, LI Tiejun, SUN Lili. Analysis of resistance situation and resistance genes of clinical isolates of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli[J]. Journal of Pharmaceutical Practice and Service, 2024, 42(10): 439-444. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202309059 |