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SDH2基因在白念珠菌环境适应性中的作用

王欣荣 鲁仁义 王彦

陈金涛, 乔子婴, 马明华, 张若曦, 王振伟, 年华. 基于网络药理学和分子对接技术研究金芪清疏颗粒治疗社区获得性肺炎的潜在机制[J]. 药学实践与服务, 2024, 42(11): 471-478. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202312014
引用本文: 王欣荣, 鲁仁义, 王彦. SDH2基因在白念珠菌环境适应性中的作用[J]. 药学实践与服务, 2022, 40(4): 309-313. doi: 10.12206/j.issn.1006-0111.202201096
CHEN Jintao, QIAO Ziying, MA Minghua, ZHANG Ruoxi, WANG Zhenwei, NIAN Hua. Study on the potential mechanism of JQQSG for the treatment of CAP based on network pharmacology and molecular docking technology[J]. Journal of Pharmaceutical Practice and Service, 2024, 42(11): 471-478. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202312014
Citation: WANG Xinrong, LU Renyi, WANG Yan. The role of SDH2 gene in the environmental adaptability of Candida albicans[J]. Journal of Pharmaceutical Practice and Service, 2022, 40(4): 309-313. doi: 10.12206/j.issn.1006-0111.202201096

SDH2基因在白念珠菌环境适应性中的作用

doi: 10.12206/j.issn.1006-0111.202201096
基金项目: 军队生物安全研究专项(20SWAQX29-1-6)
详细信息

The role of SDH2 gene in the environmental adaptability of Candida albicans

  • 摘要:   目的  探究SDH2基因在白念珠菌环境适应性中的作用。  方法  以野生型白念珠菌SC5314、SDH2基因敲除菌sdh2 Δ/Δ 、基因回复菌sdh2 Δ /SDH2为实验对象;应用点板实验考察野生型菌、SDH2缺失菌和回复菌对外界压力刺激剂和抗真菌药物的敏感性;采用罗丹明6G外排实验考察SDH2基因缺失对白念珠菌药物外排能力的影响。  结果  SDH2基因缺失后白念珠菌对细胞壁应激刺激剂咖啡因、氧化应激刺激剂二酰胺和甲萘醌表现出轻微耐受,值得注意的是SDH2基因敲除菌sdh2 Δ/Δ 对唑类抗真菌药物的敏感性明显增高,SDH2缺失导致白念珠菌药物外排能力下降。  结论  SDH2缺失会导致白念珠菌对环境适应性的改变,包括对外界环境压力应答的改变和对唑类抗真菌药物敏感性的增加,以SDH2为靶基因,开发真菌特异性SDH2抑制剂,有望发现与唑类药物协同的新型抗真菌药物。
  • 社区获得性肺炎(CAP)是指在院外由于多种微生物引起的肺实质的急性感染,临床表现以发热、咳嗽、咯痰、气短、胸闷或胸痛等症状为主[1-2]。2019年全球疾病负担研究(GBD)的数据显示,包括肺炎和细支气管炎在内的下呼吸道感染影响了全球4.89亿人[3]。全球估计每年约有320万人死于CAP,超过了包括结核病、艾滋病毒感染和疟疾在内的所有其他感染,使其成为全球传染病死亡的主要原因,其中小于5岁的儿童及大于70岁的成年人是受影响最大的人群[4]

    近年来,有大量的临床研究、实验观察以及医学报道表明,中西医联合治疗CAP取得了较好的疗效。在使用抗菌药物的基础上,加用中药能够缩短病程,尽量减少细菌耐药性的发生。同时中药在治疗过程中有着多靶点、多环节的作用机制。金芪清疏颗粒(备案号:沪药制备字Z20200011001)是上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院呼吸科专家在长期临床治疗肺脾气虚证呼吸道疾病基础上所得出的经验效方,以玉屏风散和四君子汤经典名方为基础加减化裁而成。它由金银花、黄芪、黄芩、柴胡、太子参、茯苓、白术、佩兰、防风和甘草10味药组成,具有益气清疏,健脾补肺固表,培土生金之效。现代药理学研究表明[5-15],方中所用诸药具有广泛抗炎、调节氧化应激、解热、抗菌、调节免疫等多种功效。但由于中药成分治疗靶点的复杂性,目前有关金芪清疏颗粒治疗CAP的具体机制尚不明确。本研究基于网络药理学、分子对接等方法探究其潜在作用机制,拟为后续实验研究提供理论基础。

    本研究利用TCMSP数据库[16],以金银花、黄芪、黄芩、柴胡、太子参、茯苓、白术、佩兰、防风、甘草为关键词检索药物成分,设置口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18,其他参数为默认值,进行药物成分筛选,通过查阅文献对不满足筛选要求,但含量高或者相关药物活性强的予以手动筛选添加。最终获取金芪清疏颗粒的活性成分,并通过PubChem数据库[17]获取活性成分SMILE号。若PubChem数据库未能检索出的活性成分,则通过TCMSP平台下载相关的活性成分的mol2文件,在novopro平台上将mol2文件转换为SMILE号。将所有活性成分的SMILE号导入SwissTargetPrediction数据库中获取各个化学成分的预测作用靶点,其中物种参数设置为Homo sapiens,置信度阈值(Probability>0)。利用Cytoscape3.10.0软件[18]构建金芪清疏颗粒活性成分与作用靶点网络,预测金芪清疏颗粒核心成分。

    以“Community acquired pneumonia”为检索词,分别在OMIM、TTD[19]、DisGeNET和GeneCards 4个数据库中检索CAP作用靶点,种属选择“Homo sapiens”,重复靶点仅保留1个。

    通过JVEEN(www.bioinformatics.com.cn) [20]将金芪清疏颗粒活性成分的预测靶点与CAP相关靶点进行映射,获得金芪清疏颗粒作用于CAP的潜在靶点。利用String平台构建金芪清疏颗粒作用于CAP的靶点蛋白相互作用(PPI)网络。再利用Cytoscape3.10.0软件的“Centiscape2.2”插件对PPI网络进行拓扑分析,以度数(Degree)、中介性(Betweenness)、接近中心性(Closeness)筛选出该网络的关键靶点,按Degree值进行排序,得出TOP9靶点为核心靶点,并通过Cytoscape3.10.0进行可视化分析。

    将“1.3”项中得到的金芪清疏颗粒-CAP的关键靶点的编码基因导入DAVID 数据库,DAVID 数据库的基因列表中,选择 “OFFICIAL GENE SYM-BOL”, 选定物种为“Homo sapiens”,进行GO功能及KEGG通路富集分析,利用JVEEN制作富集气泡图,进行数据可视化。

    从 TCMSP数据库查询“1.1”项中关键成分结构,并保存为 mol2 格式。从 PDB 数据库下载“1.3”项核心靶点的 3D 结构,保存为 PDB 格式,使用 PyMol软件删除蛋白结构的水分子和小分子配体,并导入 AutoDockTools 进行加氢等预处理。将活性成分和靶点蛋白均转换成 pdbqt 格式文件。最后运行 AutoDockTools 对活性成分和靶点蛋白分别进行对接,保存最低结合能数据作为分子对接的结果。

    根据筛选得到金银花23个、黄芪21个、黄芩36个、柴胡17个、太子参8个、茯苓15个、白术7个、佩兰11个、防风18个和甘草92个活性成分,删去重复值及没有作用靶点的成分,共得到金芪清疏颗粒活性成分209个,通过Swiss Target Predic-tion数据库预测相应作用靶点,删去重复值共得到1041个作用靶点。通过Cytoscape3.10.0软件将活性成分-靶点进行可视化,得到“活性成分-靶点”相互作用网络。该网络共有1291个节点和16408条边,见图1。通过软件分析得出Degree值,Degree值越高,作用关系越密切,重要性越大,按Degree值排序,得出top 9的成分为:Quercetin、Kaempferol、Luteolin、Isorhamnetin、Mandenol、Jaranol、Wogonin、Acacetin和Sitosterol,见表1

    图  1  金芪清疏颗粒“活性成分-靶点”相互作用网络
    注:不同颜色六边形代表不同药物活性成分,其中绿色六边形代表多种药物共同作用成分;棱形代表药物作用靶点;其中颜色越深,图形越大,代表相互作用关系越密切,其重要性越大。
    表  1  金芪清疏颗粒TOP9活性成分表
    化合物 分子结构 度值 中介中心性 接近中心性 口服生物利用度(%) 类药性 中药名称
    成分代号(ID)
    Quercetin(槲皮素) 420 0.00350184 0.37422037 46.43 0.28 金银花、黄芪、
    太子参、甘草
    B
    Kaempferol(山柰酚) 420 0.00343999 0.37422037 41.88 0.24 金银花、黄芪、
    柴胡、甘草
    D
    Luteolin(木犀草素) 315 0.00386583 0.37377633 31.16 0.25 金银花、太子参、佩兰 A
    Isorhamnetin
    (异鼠李素)
    315 0.0031137 0.37377633 49.60 0.31 黄芪、柴胡、
    甘草
    L
    Mandenol
    (亚麻油酸乙酯)
    230 0.02557745 0.37223043 42.00 0.19 金银花、防风 F
    Jaranol(华良姜素) 210 0.00361453 0.3735547 50.83 0.29 黄芪、甘草 J
    Wogonin(汉黄芩素) 210 0.00350745 0.37399822 30.68 0.23 黄芩、防风 O
    Acacetin(金合欢素) 210 0.00355992 0.37311223 34.97 0.24 黄芩、太子参 R
    Sitosterol(谷甾醇) 180 0.00218402 0.35502959 36.91 0.75 黄芩、防风、
    佩兰、甘草
    P
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    以“Community acquired pneumonia”为检索词分别从OMIM、DisGeNET、GeneCards(评分>3.6)、TTD 4个数据库得到645、73、1566和3个疾病靶点,删去重复值后共得到2149个CAP相关靶点。

    1041个金芪清疏颗粒活性成分作用靶点与2149个CAP相关靶点进行映射,得到312个共同靶点,绘制VEEN图,见图2。这些靶点被认为是金芪清疏颗粒治疗CAP的潜在靶点。

    图  2  金芪清疏颗粒治疗CAP潜在靶点的韦恩分析图

    将312个作用靶点导入STRING,构建PPI网络。利用Centiscape2.2插件分析,得到该网络中介性unDir:302.778,接近中心性unDir:0.002,度值unDir:45.910,取大于这三个条件筛选出该网络关键靶点64个,利用Cytoscape3.10.0进行可视化分析(图3),结果得到TOP10靶点为:GAPDH、AKT1、MAPK3、TP53、EGFR、VEGFA、ALB、TNF、SRC和JUN,见表2

    图  3  PPI网络关键靶点筛选图
    注:颜色越深,图形越大,度值越高,越重要。
    表  2  PPI 网络TOP10 靶点表
    名称度值中介中心性接近中心性
    GAPDH610.01850.9692
    AKT1610.01950.9692
    MAPK3590.01670.9402
    TP53580.01460.9265
    EGFR580.01490.9265
    VEGFA580.01450.9265
    ALB570.01680.9130
    TNF570.01330.9130
    SRC570.01270.9130
    JUN560.01010.9000
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    通过David数据库对64个核心靶点进行GO富集分析及KEGG分析。用Bioinformatics[21]制作富集气泡图。结果显示,共有571个生物过程、68个细胞组分、199个分子功能显示富集。据P<0.01进行筛选后排序,选择前20的结果。GO富集分析主要涉及在正向调节RNA聚合酶Ⅱ启动子转录,凋亡过程的负调控、信号转导、蛋白磷酸化等生物过程,见图4A;细胞质、细胞核、大分子复合物等细胞组分,见图4B;蛋白质结合、酶结合、蛋白质丝氨酸/苏氨酸/酪氨酸激酶活性,转录因子结合等分子功能,见图4C

    图  4  GO富集分析气泡图
    A.生物过程;B.细胞组分;C.分子功能注:P值显示为各节点的颜色变化,基因数显示为气泡大小。

    KEGG共富集到165条信号通路,选择与CAP密切相关的前20条,见图5。主要是PI3K/Akt信号通路、MAPK信号通路、趋化因子信号通路、TNF信号通路及细胞凋亡信号通路等。

    图  5  KEGG通路富集分析气泡图

    将“2.4”项中筛选得到部分核心靶点(GAPDH、AKT1、MAPK3、EGFR、TNF、SRC、JUN)与“2.1”项中筛选得到的部分核心成分(Quercetin, Kaempferol, Luteolin)进行分子对接。一般认为结合能<0 kJ/mol表明配体分子可以与受体分子自发结合,结合能<−20.92 kJ/mol则表示具有较好的结合能力,分子对接显示所有核心活性成分与关键靶点对接的结合能均<−20.92 kJ/mol,见表3。可视化分析结果见图6

    表  3  部分核心成分与核心靶点分子对接结果
    受体蛋白 PDB入口 配位基 亲和力(kJ/mol)
    GAPDH 8P5F 槲皮素 −30.79
    山柰酚 −29.16
    木犀草素 −30.92
    AKT1 7NH5 槲皮素 −31.67
    山柰酚 −32.47
    木犀草素 −31.46
    MAPK3 4QTB 槲皮素 −29.37
    山柰酚 −27.36
    木犀草素 −29.29
    EGFR 8A2A 槲皮素 −34.56
    山柰酚 −36.40
    木犀草素 −32.05
    TNF 5UUI 槲皮素 −26.94
    山柰酚 −26.40
    木犀草素 −27.32
    SRC 7NG7 槲皮素 −28.45
    山柰酚 −30.04
    木犀草素 −28.66
    JUN 5T01 槲皮素 −26.40
    山柰酚 −26.28
    木犀草素 −26.57
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    图  6  成分-靶点分子对接模式图

    社区获得性肺炎的发展在很大程度上取决于宿主对气道中微生物的反应,失调的宿主反应因人而异,并对生存和其他结果产生负面影响,会诱导肺部局部和全身炎症反应[22]。有研究表明出院后的3个月高炎症标志物、死亡率也随之增加。因此,调节机体的免疫及炎症反应对治疗CAP是其关键之一[4]

    炎症是由不同病原体、刺激物或细胞损伤引起的血管组织中最重要的生物反应之一。被认为是生物体对抗病原体诱导的组织损伤的保护机制。在炎症过程中,吞噬细胞的活化会导致NADPH氧化酶的组装,急剧增加ROS的产生。内源性中和系统的活性饱和会导致ROS积累,同时,由于ROS的高化学反应性,会导致针对病原体和宿主生物系统的直接非特异性毒性。增加的ROS也可通过上调参与炎症反应的几个基因来引发和放大炎症。因此ROS通路可能成为炎症治疗的潜在靶点[23]

    本研究通过网络药理学方法,筛选后得到Degree值较高的靶点为GAPDH、AKT1、MAPK3、EGFR、SRC和TNF,这些靶点能通过调节炎症反应和ROS,在治疗CAP的过程中发挥重要作用。其中GAPDH能通过影响糖酵解,阻碍巨噬细胞活化,降低促炎细胞因子的产生来抑制炎症反应[24-25]。Akt是一种多功能激酶,通过调节血管通透性,导致水肿和白细胞外渗,影响炎症反应[26-27]。炎症相关基因的表达受到转录因子的严格调控,其中NF-κB是参与免疫和炎症反应的众多基因的多效性调节因子。氧化物质能导致其易位到细胞核中,通过上调各种促炎细胞因子和酶的产生来放大炎症反应,如白介素、TNF-α和诱导型NOS,增强ROS的细胞毒性作用。MAPK参与NF-κB 转录活性的调节,影响炎症反应和凋亡介质的合成。激活的EGFR也依赖于NF-κB信号传导途径,进一步调节促炎因子表达[28-30]。酪氨酸激酶(Src)作为NF-κB 和MAPKs的主要调节蛋白酪氨酸激酶之一,它可控制NADPH氧化酶活化和ROS产生,是ROS产生和细胞内稳态的主要调节因子,通过调节Src可抑制氧化应激及改善肺损伤中的炎症级联反应[31-33]

    GO及KEGG通路富集分析显示主要涉及蛋白结合、蛋白磷酸化、细胞凋亡及PI3K/Akt信号通路、MAPK信号通路等发挥关键作用。金芪清疏颗粒的核心活性成分主要为槲皮素、山柰酚、木犀草素,皆为黄酮类药物,具有广泛的抗炎、抗氧化、抗微生物作用。其中槲皮素通过激活细胞内MAPK通路,增加细胞内GSH水平,并在清除自由基反应中提供氢供体来源,从而提高细胞的抗氧化能力,抑制氧化应激[34]。还可通过清除NF-κB活化所必需的ROS,阻断TNF-α依赖的NF-κB核转移,降低IL-1β、IL-6、TNF-α水平和NF-κB表达来减轻早期炎症[23]。 此外还有研究表明槲皮素可减轻中性粒细胞气道炎症,抑制铁细胞凋亡和M1巨噬细胞极化[35]。山柰酚能减少ROS形成,抑制iNOS、环氧合酶和一氧化氮表达水平,降低炎症反应,并抑制MAPK途径的表达,减少趋化因子和IL-8的产生而降低炎症负荷[36-37]。木犀草素则能通过抑制NO及ROS产生、清除ROS和活化抗氧化酶、抑制促炎细胞因子表达、调节NF-κB通路、AKT和MAPK通路等途径发挥抗炎抗氧化作用[38-40]。在分子对接过程中核心靶点与核心活性成分均具有较好的结合能力,与当前研究相符。

    综上所述,本研究通过网络药理学探讨了金芪清疏颗粒治疗CAP的作用机制,发现金芪清疏颗粒可能通过槲皮素、山柰酚、木犀草素等多种活性成分,作用多个疾病靶点,通过调控Akt、MAPK信号通路、改善氧化应激,发挥抗炎、抗氧化作用,从而明显改善肺部感染的炎症反应及肺部损伤,发挥保护作用。本研究证明金芪清疏颗粒具有多成分、多靶点、多通路的作用特点,为后续进一步深入研究其具体作用机制奠定基础。但仍缺乏相关实验验证,后续应进一步围绕氧化应激与炎症作用机制开展实验设计。

  • 图  1  SDH2基因缺失菌与野生型菌株对各种应激刺激剂的敏感性

    A. 25 ℃下培养;B. 30 ℃下培养;C. 37 ℃下培养

    图  2  SDH2基因缺失菌与野生型菌株对抗真菌药物的敏感性

    A. 25 ℃下培养;B. 30 ℃下培养;C. 37 ℃下培养

    图  3  SDH2基因缺失菌与野生型菌株对罗丹明6G的外排能力

    #P<0.05,与25 ℃比较;**P<0.01,与WT比较

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  • 期刊类型引用(1)

    1. 邢信昊,王欣荣,陈莉,仲华,韩蕾,王彦. MIR1基因影响白念珠菌对唑类药物的敏感性. 中南药学. 2023(05): 1125-1129 . 百度学术

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出版历程
  • 收稿日期:  2022-01-26
  • 修回日期:  2022-06-23
  • 网络出版日期:  2022-07-27
  • 刊出日期:  2022-07-25

SDH2基因在白念珠菌环境适应性中的作用

doi: 10.12206/j.issn.1006-0111.202201096
    基金项目:  军队生物安全研究专项(20SWAQX29-1-6)
    作者简介:

    王欣荣,硕士研究生,Email:yunhubuxi7799@163.com

    鲁仁义,讲师,Email:lurenyi@smmu.edu.cn

    通讯作者: 王 彦,博士,教授,博士生导师,研究方向:药理学,Email:wangyansmmu@126.com
  • 中图分类号: R978.5

摘要:   目的  探究SDH2基因在白念珠菌环境适应性中的作用。  方法  以野生型白念珠菌SC5314、SDH2基因敲除菌sdh2 Δ/Δ 、基因回复菌sdh2 Δ /SDH2为实验对象;应用点板实验考察野生型菌、SDH2缺失菌和回复菌对外界压力刺激剂和抗真菌药物的敏感性;采用罗丹明6G外排实验考察SDH2基因缺失对白念珠菌药物外排能力的影响。  结果  SDH2基因缺失后白念珠菌对细胞壁应激刺激剂咖啡因、氧化应激刺激剂二酰胺和甲萘醌表现出轻微耐受,值得注意的是SDH2基因敲除菌sdh2 Δ/Δ 对唑类抗真菌药物的敏感性明显增高,SDH2缺失导致白念珠菌药物外排能力下降。  结论  SDH2缺失会导致白念珠菌对环境适应性的改变,包括对外界环境压力应答的改变和对唑类抗真菌药物敏感性的增加,以SDH2为靶基因,开发真菌特异性SDH2抑制剂,有望发现与唑类药物协同的新型抗真菌药物。

English Abstract

陈金涛, 乔子婴, 马明华, 张若曦, 王振伟, 年华. 基于网络药理学和分子对接技术研究金芪清疏颗粒治疗社区获得性肺炎的潜在机制[J]. 药学实践与服务, 2024, 42(11): 471-478. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202312014
引用本文: 王欣荣, 鲁仁义, 王彦. SDH2基因在白念珠菌环境适应性中的作用[J]. 药学实践与服务, 2022, 40(4): 309-313. doi: 10.12206/j.issn.1006-0111.202201096
CHEN Jintao, QIAO Ziying, MA Minghua, ZHANG Ruoxi, WANG Zhenwei, NIAN Hua. Study on the potential mechanism of JQQSG for the treatment of CAP based on network pharmacology and molecular docking technology[J]. Journal of Pharmaceutical Practice and Service, 2024, 42(11): 471-478. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202312014
Citation: WANG Xinrong, LU Renyi, WANG Yan. The role of SDH2 gene in the environmental adaptability of Candida albicans[J]. Journal of Pharmaceutical Practice and Service, 2022, 40(4): 309-313. doi: 10.12206/j.issn.1006-0111.202201096
  • 白念珠菌是一种条件致病真菌,在健康人体口腔或胃肠道中以无害共生菌的形式存在。在免疫功能低下的患者中,能够导致危及生命的全身性感染。近年来,随着癌症患者、器官移植接受者等免疫功能低下人群不断增加,白念珠菌感染引发的严重疾病的发病率不断攀升[1-2],死亡率粗略估计已高于40%[3]

    高适应性是白念珠菌传播和致病的关键因素之一,包括对宿主和外界环境的适应性、形态的转换以及对抗真菌药物的适应性。代谢的改变能够影响白念珠菌的药物敏感性,Ene等[4]发现培养基中碳源由葡萄糖转变为乳酸后白念珠菌对抗真菌药物(咪康唑、两性霉素B、卡泊芬净)的敏感性发生改变。线粒体作为重要的代谢细胞器, 其中的某些基因缺失或者功能缺陷,会导致白念珠菌药物敏感性的变化,Sun等[5]发现线粒体复合体I相关基因GOA1NDH51的缺失会导致白念珠菌对唑类药物敏感性上升,Edwina等[6]的研究发现线粒体关键基因FZO1的缺失能够增强白念珠菌对唑类药物的敏感性。

    本课题组前期发现SDH2基因缺失导致白念珠菌致病力显著下降,并发现白念珠菌无法利用非发酵碳源[7]。生物信息学分析显示SDH2基因编码琥珀酸脱氢酶(SDH)的铁硫亚基,琥珀酸脱氢酶在三羧酸循环和线粒体电子传递链中均发挥作用,是能量代谢中重要的一环。SDH2基因可能在白念珠菌代谢过程中发挥重要的作用,那么它是否能够通过影响代谢从而改变白念珠菌的环境适应性呢?本研究聚焦SDH2基因对白念珠菌环境适应性的影响,包括对外界压力应答和药物敏感性的影响,并探索其可能的机制。

    • 挑取少量冻存于−80℃、30% 甘油中的菌株,在YPD 液体培养基中活化,30℃,200 r/min振荡培养24 h后,吸取10 μl置于新的1 ml YPD液体培养基中,继续在 30℃,200 r/min振荡条件下培养 16 h,用 SDA 固体培养基划板,30℃培养 48 h,置于 4℃ 保存备用。实验时挑取 SDA 平板上的单克隆菌落置于1 ml YPD 液体培养基中,30℃,200 r/min振荡培养 16 h 过夜,使其处于对数生长期用于后续实验。

    • 白念珠菌活化16 h ,用YPD液体培养基调整菌浓度至3×106细胞/ml。制备每种菌株的系列稀释液,以10倍倍比稀释成5个浓度梯度,每种白念珠菌的系列浓度稀释物各取5 μl,点在事先加入了待考察的不同浓度的化学试剂和药物的YPD琼脂平板上,倒置于孵箱内,25、30、37 ℃培养24~48 h,期间观察各菌株之间生长的差异并拍照记录。

    • 收集处于对数生长期的白念珠菌细胞悬浮液,用无菌PBS洗涤3次。随后将细胞重悬于无菌PBS中调整其浓度至5×107细胞/ml,孵育2 h以耗尽能量,并加入终浓度为10 μmol/L的罗丹明6G。30℃、200 r/min振荡培养细胞悬浮液60 min,使罗丹明6G积累。洗涤白念珠菌细胞悬浮液3次,注意要保证白念珠菌细胞最终浓度为5×107细胞/ml。然后加入终浓度为20 mmol/L的葡萄糖。分别在25 、30、37℃ 条件下,200 r/min振荡培养白念珠菌细胞悬浮液2 h,取白念珠菌细胞样品(约1 ml)离心,收集上清液,在527 nm处测量吸光度。

    • 使用GraphPad Prism软件对全部数据进行分析,时序检验 (Mantel Cox) 方法比较各组差异 ,当P<0.05时,表示差异具有统计学意义。

    • 我们利用多种刺激剂考察了SDH2在白念珠菌应激反应中的作用。实验应用了sdh2Δ/Δ敲除菌、野生型菌和回复菌,考察在存在应激刺激剂的培养基中sdh2Δ/Δ敲除菌的生长情况与野生型菌和回复菌的区别,从而判断SDH2在白念珠菌应激反应中的作用。应激刺激剂包括细胞壁应激刺激剂(十二烷基硫酸钠和咖啡因)、渗透压应激刺激剂(氯化钠)、氧化应激刺激剂(过氧化氢、二酰胺和甲萘醌)。敏感性实验在25、30、37 ℃三种不同的温度下进行,将不同浓度相同体积的白念珠菌接种于琼脂培养板上,同样的培养板制备3份,白念珠菌生长形成明显的菌落后拍照。结果显示,与野生型菌或回复菌相比,sdh2Δ/Δ敲除菌于25 ℃在0.03%十二烷基硫酸钠培养板上生长得多(图1A)。此外,在所有培养温度下,sdh2Δ/Δ敲除菌在含咖啡因、二酰胺或甲萘醌的培养板上也较野生型菌/回复菌生长得多 (图1A、1B1C)。

      图  1  SDH2基因缺失菌与野生型菌株对各种应激刺激剂的敏感性

    • 我们考察了sdh2Δ/Δ敲除菌、野生型菌和回复菌对抗真菌药物的敏感性,考察的药物包括唑类抗真菌药物特比萘芬、两性霉素B、氟胞嘧啶和阿尼芬净。将不同浓度相同体积的白念珠菌接种于琼脂培养板上,同样的培养板制备3份,白念珠菌生长形成明显的菌落后拍照。药物敏感性实验结果显示,与野生型菌/回复菌相比,sdh2Δ/Δ敲除菌在含有氟康唑、酮康唑和伊曲康唑的培养板上生长得明显减少(图2A2B2C),而在含有其他抗真菌药物,如特比萘芬、两性霉素B、氟胞嘧啶和阿尼芬净的培养板上没有明显差别。

      图  2  SDH2基因缺失菌与野生型菌株对抗真菌药物的敏感性

    • 罗丹明6G是ABC(ATP-binding cassette)转运蛋白的特异性底物,在能量不足时以被动扩散的方式进入白念珠菌细胞,加入葡萄糖供能后,可通过药物外排泵以主动转运的方式泵出细胞外。我们通过罗丹明6G的外排实验考察了SDH2敲除对白念珠菌药物外排能力的影响。结果显示在30 ℃和37 ℃ 培养温度下,通过添加葡萄糖以启动能量代谢2 h后,与野生型菌相比,从sdh2Δ/Δ敲除菌的细胞中泵出的罗丹明6G显著减少(P<0.01,见图3)。有趣的是,在25 ℃ 的培养温度下,3种菌株泵出的罗丹明6G都较30 ℃和37 ℃条件下有所减少,但各菌株之间没有显著差异(图3)。

      图  3  SDH2基因缺失菌与野生型菌株对罗丹明6G的外排能力

    • SDH2编码琥珀酸脱氢酶中的一个亚基,琥珀酸脱氢酶参与三羧酸循环,并且它位于线粒体内膜上,发挥电子传递的作用,对于能量代谢十分重要[8]。我们对SDH2基因在白念珠菌环境适应性中的作用进行了初步探索,实验选择在30 ℃(白念珠菌最适宜生长温度)、37 ℃(宿主温度)和25 ℃(室温)三种温度下进行。实验之所以选用三种温度,一方面是由于在不同环境温度下白念珠菌的代谢可能不同,选用不同的温度可以考察温度造成的差别;另一方面在三种温度下考察SDH2基因的功能,结果相互之间可以比较或者印证,增加信息量,有利于分析SDH2基因的功能。有意思的是SDH2基因缺失后菌株对唑类抗真菌药物(氟康唑、酮康唑、伊曲康唑)的敏感性显著上升,而对于其他类型的抗真菌药物包括丙烯胺类特比萘芬、多烯类两性霉素B、核苷类氟胞嘧啶和棘白菌素类阿尼芬净,其敏感性和野生型菌没有差异。唑类药物的敏感性与药物外排泵的功能密切相关,药物外排功能障碍可导致对唑类抗真菌药物敏感性增加[9]。药物外排泵包括ABC转运蛋白超家族和主要易化因子超家族,其中ABC转运蛋白中的Cdr1p、Cdr2p发挥作用都需要消耗能量。罗丹明6G是能量依赖型ABC转运蛋白的特异性底物,通过外排泵以能量依赖的主动转运方式排出细胞外。罗丹明6G外排实验的结果能显示能量依赖型ABC转运蛋白的功能。研究发现SDH2缺失后白念珠菌在30 ℃和37 ℃时外排能力都显著降低。SDH2对能量代谢非常重要,SDH2基因缺失后,菌株能量代谢异常,能量依赖型ABC转运蛋白的功能下降,缺失菌对唑类抗真菌药物的敏感性增加。

      SDH2基因缺失后白念珠菌对咖啡因、二酰胺和甲萘醌都表现出轻微的耐受,这提示SDH2基因在白念珠菌环境应激中有一定的作用,这些环境因素包括细胞壁压力的刺激以及氧化刺激,具体的作用机制还有待进一步探讨。

      综上所述,本研究发现SDH2基因缺失会导致白念珠菌对环境压力应激反应的改变;此外,SDH2基因缺失后菌株的药物外排能力降低,菌株对唑类抗真菌药物的敏感性增加。代谢对白念珠菌的环境适应能力和致病力十分重要,SDH2基因缺失导致白念珠菌对唑类抗真菌药物专特性地敏感,以SDH2为靶基因,开发真菌特异性SDH2抑制剂,有望发现与唑类药物协同的新型抗真菌药物。

参考文献 (9)

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