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基于CiteSpace的布鲁氏菌病文献计量学分析

宋凯 张元林 孙蕊 郭明明 韩丹 任磊 舒丽芯

宋凯, 张元林, 孙蕊, 郭明明, 韩丹, 任磊, 舒丽芯. 基于CiteSpace的布鲁氏菌病文献计量学分析[J]. 药学实践与服务, 2023, 41(5): 310-315. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202210013
引用本文: 宋凯, 张元林, 孙蕊, 郭明明, 韩丹, 任磊, 舒丽芯. 基于CiteSpace的布鲁氏菌病文献计量学分析[J]. 药学实践与服务, 2023, 41(5): 310-315. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202210013
SONG Kai, ZHANG Yuanlin, SUN Rui, GUO Mingming, HAN Dan, REN Lei, SHU Lixin. Bibliometric analysis of brucellosis by CiteSpace[J]. Journal of Pharmaceutical Practice and Service, 2023, 41(5): 310-315. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202210013
Citation: SONG Kai, ZHANG Yuanlin, SUN Rui, GUO Mingming, HAN Dan, REN Lei, SHU Lixin. Bibliometric analysis of brucellosis by CiteSpace[J]. Journal of Pharmaceutical Practice and Service, 2023, 41(5): 310-315. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202210013

基于CiteSpace的布鲁氏菌病文献计量学分析

doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202210013
基金项目: 军队后勤科研课题药材储备情报数据库和遴选应用评估平台建设(A3703022001)
详细信息
    作者简介:

    宋 凯,硕士研究生,主治医师,研究方向:军队药物政策研究,Email:176062719@qq.com

    通讯作者: 舒丽芯,博士,副教授,研究方向:军队药物政策研究,Email:luky_shu@sina.com

Bibliometric analysis of brucellosis by CiteSpace

图(7) / 表(7)
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出版历程
  • 收稿日期:  2022-10-10
  • 修回日期:  2022-11-17
  • 网络出版日期:  2023-07-14
  • 刊出日期:  2023-05-25

基于CiteSpace的布鲁氏菌病文献计量学分析

doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202210013
    基金项目:  军队后勤科研课题药材储备情报数据库和遴选应用评估平台建设(A3703022001)
    作者简介:

    宋 凯,硕士研究生,主治医师,研究方向:军队药物政策研究,Email:176062719@qq.com

    通讯作者: 舒丽芯,博士,副教授,研究方向:军队药物政策研究,Email:luky_shu@sina.com

摘要:   目的   通过检索布鲁氏菌病相关文献,对布鲁氏菌疾病研究的热点以及领域进行可视化文献计量学分析。  方法  以Brucella Disease或 Brucellosis为关键词,在Web of science核心集数据库中进行主题检索,检索1985年1月至2021年12月期间的文献。运用CiteSpace对检索出的相关文献中的国家、机构、作者及关键词进行可视化分析。  结果  研究共纳入符合条件文献4 495 篇,美国是发文量最多国家,圣保罗大学是最有影响力的研究机构。我国吉林大学、新疆石河子大学在该领域较有影响力。对关键词分析中,高频词排名前3的为感染(infection)、诊断(diagnosis)、流产(abortus),在形成的12个聚类中,#1、#4形成的聚类较大且研究热点一直延续。近五年的关键词突现中,人布鲁氏菌病(human brucellosis)、免疫(immunization)、人畜共患病(zoonotic disease)突现强度较高。  结论  本研究结果表明人布鲁氏病与人畜共患病是布鲁氏菌病研究的热点,更多学者关注的是牛作为中间宿主的传染途径和其他的暴露风险,关于布鲁氏菌病的流行病学研究或将是新趋势。

English Abstract

宋凯, 张元林, 孙蕊, 郭明明, 韩丹, 任磊, 舒丽芯. 基于CiteSpace的布鲁氏菌病文献计量学分析[J]. 药学实践与服务, 2023, 41(5): 310-315. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202210013
引用本文: 宋凯, 张元林, 孙蕊, 郭明明, 韩丹, 任磊, 舒丽芯. 基于CiteSpace的布鲁氏菌病文献计量学分析[J]. 药学实践与服务, 2023, 41(5): 310-315. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202210013
SONG Kai, ZHANG Yuanlin, SUN Rui, GUO Mingming, HAN Dan, REN Lei, SHU Lixin. Bibliometric analysis of brucellosis by CiteSpace[J]. Journal of Pharmaceutical Practice and Service, 2023, 41(5): 310-315. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202210013
Citation: SONG Kai, ZHANG Yuanlin, SUN Rui, GUO Mingming, HAN Dan, REN Lei, SHU Lixin. Bibliometric analysis of brucellosis by CiteSpace[J]. Journal of Pharmaceutical Practice and Service, 2023, 41(5): 310-315. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202210013
  • 布鲁氏菌病(brucellosis)是由布鲁氏菌(Brucella)属的细菌侵入机体后引起传染-变态反应性人畜共患的传染病[1]。急性期患者以发热、乏力、多汗、肌肉关节疼痛和肝、脾、淋巴结肿大为主要表现[2]。布鲁氏菌病感染的严重并发症并不罕见,每100例患者中有1例心内膜炎和4例神经系统病例,十分之一的人患有附睾-睾丸炎,约一半的患者有关节痛、肌痛和背痛(分别为 65%、47% 和 45%)等虚弱症状[3]。布鲁氏菌病自古以来就是世界范围内具有重大动物福利和经济影响的人畜共患疾病。新发地区布鲁氏菌病的出现以及野生和家畜布鲁氏菌病的传播在疾病危险因素评估、残疾调整生命年(DALY)及疾病控制干预措施研究等方面具有重要意义[4]

    布鲁氏菌病早已列入世界卫生组织预防和控制传染病建议策略的传染病名单里,在我国传染病分类中属于乙类。2019年中国农业科学院兰州兽医研究所曾出现布鲁氏杆菌感染事件,最终造成6 620人抗体阳性。布鲁氏菌作为生物战剂的研究与应用,在全球生物安全方面也越来越受到重视。

    目前,国外对布鲁氏杆菌病的研究集中在流行病学和临床病例方面[5],但缺乏对其研究热点、研究趋势及研究现状的总结和分析。本文采用web of science(WOS)核心集数据库进行数据挖掘,核心数据主要收录全球有影响力的期刊文献。利用文献可视化软件CiteSpace 6.1 R3进行分析,预测该领域研究的热点和趋势[6],为深入开展布鲁氏菌病的研究和情报采集工作提供借鉴。

    • 以web of science核心数据集为数据库来源,检索式为 “Brucella Disease(主题)OR Brucellosis (主题)”进行检索,时间跨度为1985年1月至2021年12月,剔除会议、新闻等文章,共获得4 495篇期刊论文。每条数据下载为全记录纯文本格式。

    • 将全记录纯文本信息导入CiteSpace 6.1 R3。设置参数:时间切片为1985-2021年,单个时间切片为1年;阈值设置为Top 50,分别对作者合著、国家和合作机构情况、关键词聚类等进行可视化网络分析。

    • 布鲁氏菌病发文量前10的期刊见表1,其中发文100篇以上的期刊是PLOS ONE(135篇)、TROPICAL ANIMAL HEALTH AND PRODUCTION(115篇)、INTERNATIONAL JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES(103篇)。布鲁氏菌病研究文献年度发文量见图1,表明有关布鲁氏菌病的研究自2007年后呈上升趋势,近15年的平均发文量331篇,2021年发文量最大,为410篇。随着全球经济的发展和畜牧业需求量的增大,对布鲁氏菌病的研究越来越受到重视,并形成了一定的规模。

      表 1  布鲁氏菌病研究文献发表期刊分布

      序号期刊发文量影响因子
      1PLOS ONE1353.752
      2TROPICAL ANIMAL HEALTH AND PRODUCTION1151.893
      3INTERNATIONAL JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES10312.073
      4PREVENTIVE VETERINARY MEDICINE993.372
      5VACCINE784.169
      6VETERINARY MICROBIOLOGY683.246
      7PLOS NEGLECTED TROPICAL DISEASES674.781
      8REVUE SCIENTIFIQUE ET TECHNIQUE OFFICE INTERNATIONAL DES EPIZOOTIES660.836
      9INFECTION AND IMMUNITY553.616
      10JOURNAL OF WILDLIFE DISEASES521.626

      图  1  布鲁氏菌病研究文献年度发文分布

    • 在纳入研究的4 495篇文献中,134 个国家、426 个机构及827名作者对此类研究做出贡献。美国是发文量最多的国家(727 篇),其次是土耳其(518 篇)和中国(517 篇);美国圣保罗大学(93 篇)是最具影响力的科研机构,其次是巴西米纳斯吉拉斯联邦大学(77 篇)、南非比勒陀利亚大学(56 篇)。在CiteSpace可视化图谱中展示出有突出贡献的研究团队和潜在合作者的信息,大致可分为 4 个主要团队:① WANG Y团队,主要研究方向为布鲁氏杆菌的机制研究;② KIM S团队,主要研究方向为布鲁氏病的诊断和临床研究;③ MELZER F团队,主要研究方向为布鲁氏菌属和布鲁氏菌侦检技术;④ FERREIRA NETO J团队,主要研究方向为牛布鲁氏杆菌的流行病学研究。发文作者可视图谱中,发文量最多的作者是中国吉林大学第一附属医院的WANG YANG,其发文量Nmax=73。根据普赖斯公式计算,核心作者最小发文量 M≈0.749×N1/2max,计算得到 M=6.399,统计发文量 ≥7 篇的核心作者共 181 人。发文量前3名的作者是 WANG Y、LI Z、KIM S,见表2。根据可视化研究分析发现近期有突现作者出现,可能是新的研究团队的出现,这些团队也值得关注,见表3

      表 2  2007-2021年发文量排名前10的作者

      排序作者发文量发文起始年
      1WANG Y732012
      2LI Z522014
      3KIM S492010
      4ZHANG J492014
      5FERREIRA NETO J472009
      6MELZER F472007
      7NEUBAUER H452007
      8ZHANG H422014
      9GODFROID J402010
      10DIAS R372009

      表 3  2007-2021年排名前10的突现作者

      排序作者突现值发文起始年
      1FERREIRA NETO J12.452009
      2LIU Z11.722015
      3HEINEMANN M11.222013
      4LI J10.082016
      5LI Z9.542014
      6ZHANG J8.002014
      7LAGE A7.572009
      8ZHANG Y7.562016
      9WEINER M7.412011
      10LI Y7.232015
    • 频次和中心性排名前5的关键词见表4,关键词共现图见图2。2007―2021年关于布鲁氏杆菌的关键词聚类分为12类,轮廓值在0.848~1.000,整体聚类较好,可信度较高(图3表5)。关键词时间线图共形成12个聚类,并能从各个聚类中展现其历史跨度和研究的趋势(图4)。关于感染(infection)、诊断(diagnosis)、流产(abortus)是研究人员关注的热点话题;区分(differentiation)、抗原(antigen)中心性较高,说明对于该方面的研究同质性高、有较为集中的研究;关键词聚类分析中,#0 vaccination program(疫苗接种计划)聚类最大,#11 unusual presentation(罕见症)聚类最小;关键词时间线图可以揭示#1、#4聚类研究热点的演变。

      表 4  频次和中心性排名前5的关键词

      排序频次关键词中心性关键词
      1764infection0.58differentiation
      2579diagnosis0.5antigen
      3561abortus0.49virulence
      4521melitensis0.47identification
      5383brucella abortus0.45escherichia coli

      图  2  关键词共现图

      图  3  关键词聚类图

      表 5  关键词聚类列表

      聚类号聚类名称轮廓值聚类大小平均发文年
      0vaccination program0.88202012
      1dairy cattle1202011
      2brucella melitensis0.966172009
      3bovine brucellosis0.975162008
      4risk factor0.95152013
      5red deer0.95142008
      6zoonotic diseases1132010
      7molecular detection0.956132010
      8murine monoclonal antibodies0.874122008
      9recombinant brucella0.848122011
      10field strain0.99112010
      11unusual presentation1112008

      图  4  关键词时间线图

    • 以参考文献为节点,得到共被引文献图谱(图5)。排名前5的高被引文献和高中心性被引文献见表6表7。高被引文献多数为综述文献,中心性和被引频次较高的经典文献主要讨论布鲁氏杆菌的流行病学变化和并发症的治疗等方面。

      图  5  共被引文献网络图

      表 6  共被引频次排名前5的文献

      题目作者发文年被引次数
      新的全球人类布鲁氏菌病地图Pappas G2006151
      布鲁氏菌病Pappas G2005119
      1028例布鲁氏菌病的临床表现和并发症:回顾性评价和文献回顾Buzgan T201092
      布鲁氏菌病的发病机制与免疫生物学布鲁氏菌与宿主相互作用研究进展de Figueiredo P201592
      人类布鲁氏菌病的临床表现:系统回顾与Meta分析Dean AS201291

      表 7  共被引中心性排名前5的文献

      题目作者发文年中心性
      1955-2014年中国人布鲁氏菌病流行病学的变化Lai SJ20170.19
      人类布鲁氏菌病——病因学、诊断学和临床表现Galinska EM20130.19
      布鲁氏菌作为生物武器Pappas G20060.19
      1028例布鲁氏菌病的临床表现和并发症:回顾性评价和文献回顾Buzgan T20100.17
      一种隐秘的胞内布鲁氏菌病原体的进化策略Martirosyan A20110.17

      被引文献的聚类词可以反映研究领域的基础知识框架[7]。从文献聚类图谱上看(图6),人布鲁氏杆菌病、c小鼠、家庭成员间传播、怀孕率、儿童布鲁氏菌病等构成近5年布鲁氏杆菌病研究领域的基础框架。

      图  6  共被引文献聚类图

    • 对关键词和聚类图谱分析得出,疫苗接种、畜牧业、布鲁氏杆菌3个方面形成了比较集中的聚类。按照关键词突现图分析(图7),在持续8年(2007-2015)的研究中,并发症(complication)一直是该领域的研究热点。2019 年以来研究热点有了新变化,主要有人布鲁氏菌病(human brucellosis)、人畜共患病(zoonotic disease)、风险(risk)、爆发(outbreak)、多重PCR分析(multiplex PCR assay)等。布鲁氏菌病从发现至今已有百年历史,其研究热点也逐渐迁移。总体来看,研究可大致分为三个阶段,第一阶段(2007-2013)注重布鲁氏杆菌病的并发症及发病机制的研究;第二阶段(2013-2018)注重布鲁氏杆菌免疫学及病原学的研究;第三阶段(2018-2021)注重布鲁氏杆菌的流行病学研究。

      图  7  关键词突现图

      从研究国家来看,目前以美国、土耳其、中国对该病种研究较多;从研究机构上看,圣保罗大学、米纳斯吉拉斯联邦大学、比勒陀利亚大学、吉林大学的研究发文量最多,形成了以圣保罗大学和比勒陀利亚大学为核心的密切合作网络。中国的吉林大学、石河子大学也在该领域占有一席之地,但由于缺乏与其他国家机构的合作,国际影响力不足,未来中国研究机构应加强跨国家、跨地区、跨机构合作。

      共被引文献代表该研究领域的知识基础。Pappas 等[8]的研究论文被引用151次,该文章总结了前期的研究,对后续的研究具有指导意义。对关键词的聚类分析来看,关键词 “differentiation”、“antigen” 的中心性均>0.5,轮廓值越高说明该聚类成员间一致性越好,表5中#1、#6、#11的轮廓值最高;图3可以看出#0、#3、#5、#8、#9相互重叠,联系较为紧密;图4中体现了各聚类演变的时间跨度,#1、#2、#3、#4、#7时间跨度大,研究时间长,聚类领域较为重要;图7清晰体现了近年来研究热点的变迁,“linked immunosorbent assay” 突现强度最大,从2007年激增到2011年,“human brucellosis” 和 “zoonotic disease” 突现强度高,近年来研究热点逐步转移到人患病的诊断上。

      从研究趋势上来看,关键词聚类分析中,#4平均年是距当前最近的,且聚类大小较大,同质性较好,#0和#1聚类大小最大,平均年距当前较近,其中#1同质性最好,可推断#1和#4将成为布鲁氏菌病研究新趋势。聚类#1 dairy cattle中,布鲁氏菌病是人畜共患病,其中牛是外溢宿主。在印度,布鲁氏菌病导致的平均经济损失中,牛的损失最高[4,9]。布鲁氏菌病研究领域中,人类布鲁氏菌病和人畜共患病作为两个突现热点近年来被广泛关注[10-11],我们可推断有特定暴露环境的畜牧业及作为中间宿主的牛,在布鲁氏菌病的传播方面更有研究价值。聚类#4 risk factor中,人传染布鲁氏菌病的风险因素主要有直接接触病畜、动物源食品接触和实验室暴露,人间传播罕见[10,12]。布鲁氏菌病的风险因素是近年来的研究热点,突现强度仅次于人类布鲁氏菌病和人畜共患病[13-14]。从源头上规避风险是预防布鲁氏菌病的较好方式,但在流行病区很难实现[15]

      本文通过CiteSpace对布鲁氏菌病的研究进展进行可视化分析,系统梳理了相关领域文献,发现布鲁氏菌病的研究热度逐年上升,近年来的研究热点是“human brucellosis”和“zoonotic disease”,研究趋势是 “dairy cattle”和“risk factor”。本文提出以下建议:①中国研究机构应加强跨地域、跨机构合作,提高国际影响力;②学者间需进行更多高质量合作研究,中国学者应加强与国外核心团队的合作;③布鲁氏菌病的预防、诊断和治疗应多学科联动发展推进;④尽早地在高发地区组织筛查、健康教育与畜牧业的抽检,能够有效避免并发症的出现。希望本文可以为相关科研人员拓宽研究思路,但由于CiteSpace软件自身局限性且对数据的分析仅限于WOS数据库,本文仅依赖于文献计量学的分析同样具有局限性,故在以本文为参考的同时,应该借鉴临床知识及其他相关分析来综合判断[16]

参考文献 (16)

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